fltFormatter のソースコード

#!
# coding: utf-8
# Copyright (C) 2017 TOPS SYSTEMS
### @file fltFormatter.py
### @brief FLT format data file Formatter
###
### FLTファイルのデータを再整形して出力する
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### Contact: izumida@topscom.co.jp
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### @author: M.Izumida
### @date: April 12, 2017
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# Original: flt2pic.py v01r02 April 7, 2017 FLT FILE OUT FUNCTIONS
# Written for Python 2.7 (NOT FOR 3.x)
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# インポート宣言
import sys
import re
import argparse
import os
import numpy as np
from datetime import datetime
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# バージョン文字列
versionSTR = "fltFormatter.py v01r01 Tops Systems (pgm by mpi)"
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# 共通サブルーチン
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def errPrint(mes):
    """errPrint.

    エラー出力へのメッセージ表示
    後の始末はその後で別に書くこと
    """
    sys.stderr.write(mes)
    sys.stderr.write('\n')

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def stdExceptionHandler(mes):
    """standard Exception Handler.

    エラーメッセージを送出し、デバッグのための情報を出力する
    """
    errPrint("Exception Captured: " + str(mes))
    errPrint("0:" + str(sys.exc_info()[0]))
    errPrint("1:" + str(sys.exc_info()[1]))
    errPrint("2:" + str(sys.exc_info()[2]))

#-------------------------------------------------------------------
def tryIntParse(st, dval, radix=10):
    """try Parse string to Integer

    文字列stをパースして整数化できれば値を返す、できなければデフォルト値dvalを返す
    """
    try:
        work = int(st, radix)
    except:
        return dval
    return work

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# 解析オプション クラス
class Options:
    """Options Class.

    グローバルオプションを保持するクラス
    """
    pass

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# FLTファイルリーダクラス
[ドキュメント]class FltFileReader: """FltFile Reader Class. FLTファイルを読みとり、ターゲットの配列であれば Numpy ndarrayとして確保する。 """ #-------------------------------------------------------------------- def __init__(self, inputFnam, targetArrayName): """FLT File Reader Constructor コンストラクタ """ self.iFname = inputFnam #<<! 入力FLTファイル名 self.tName = targetArrayName #<<! 処理対象FLT配列名 # レコードヘッダ、トレイラの検索表現 self.headerRE = re.compile("^\@([a-zA-Z_][a-zA-Z0-9_]*)\<FLOAT\>\[([0-9]+)\,\s*([0-9]+)\]\s*\{") self.trailerRE = re.compile("^}\s*nREC\=([0-9]+)\,\s*CONV_ERR_CODE\=([0-9]+)\,\s*CONV_ERR_COUNT\=([0-9]+)"); # 配列データ保持構造 self.clearArray() self.inData = False # debug self.debug = False self.verbose = False #--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def clearArray(self): """Clear Array method 配列の一時記憶構造を初期化する """ self.nArray = None #<<! Numpy 配列の格納用アンカー self.iX = 0 #<<! FLT配列のXサイズ self.iY = 0 #<<! FLT配列のYサイズ self.nData = 0 #<<! FLT配列の要素カウント self.nX = 0 #<<! Numpy配列の処理ロケーションX self.nY = 0 #<<! Numpy配列の処理ロケーションY self.readStatus = 0 #<<! 読み取りステータス 0=読み取り開始, 1=読み取り正常終了, 2=読み取りエラー
#--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def read(self): """Read method FLTファイルを読み込むメソッド。読み込み成功すれば真を返す。 """ try: with open(self.iFname, 'r') as f: for line in f: if self.rLine(line): break except: stdExceptionHandler("Error: in file reading = " + self.iFname) return False if self.readStatus == 1: return True return False
#--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def rLine(self, lin): """Read Line method 読み取った1行を処理するメソッド inData フラグが立っていれば、 ①レコード末尾行であればパラメータを読み取ってチェックする チェック結果で問題あればエラー終了 問題なければ正常終了 inDataフラグを下す ②レコード末尾行でなければデータ行として、配列にため込む inData フラグが立っていなければ ①配列ヘッダ行であればパラメータを読み取って該当か否か判断する。 該当データであれば inData フラグを立て、配列を初期化して処理に進む。 読み取りが必要な間、Falseを返す。読み取り完了またはエラー時にはTrueを返す """ if self.inData: trailer = self.trailerRE.match(lin) if trailer: if self.nX != 0: print "WARNING: X=", self.nX, " Y=", self.nY nREC = tryIntParse(trailer.group(1), 0) if self.nData != nREC: errPrint("ERROR: " + lin ) errPrint("ERROR: Trailer size mismatch. Actual=" + str(self.nData) + " nREC=" + str(nREC)) self.readStatus = 2 else: if self.verbose: print "--> trailer, nREC=" + str(nREC) self.readStatus = 1 self.inData = False return True else: if self.nY >= self.iY: errPrint("ERROR: Too much data, Y=" + str(self.nY) + ":" + str(self.iY)) self.readStatus = 2 return True dlis = lin.split(",") for item in dlis: try: fdata = float(item.strip()) except: continue self.nData += 1 self.nArray[self.nX][self.nY] = fdata # nX, nYの更新 self.nX +=1 if self.nX >= self.iX: if self.debug: print "Y:" + str(self.nY) + " X:" + str(self.nX) + ":" + str(self.iX) + ":#=" + str(self.nData) self.nY += 1 self.nX = 0 else: header = self.headerRE.match(lin) if header: aname = header.group(1) if self.verbose: print "Find array header:" + aname if aname.startswith(self.tName): self.clearArray() self.iX = tryIntParse(header.group(2), 0) self.iY = tryIntParse(header.group(3), 0) if (self.iX * self.iY) < 1: errPrint("ERROR: Unexpected Array size ?=" + lin) return True self.inData = True if self.verbose: print "--> TARGET ARRAY, x:{0} y:{1}".format(self.iX, self.iY) self.nArray = np.zeros((self.iX, self.iY), dtype=np.float) # Numpy Arrayを0初期化で生成 return False
#--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def ipCalc(self, nd): """Inner Product Calculation 保持しているnArrayと外から与えられたndの間の内積を取って結果を出力する。 外から与えられたndは1次元化し、保持するnArrayのxと掛け合わせる。 xの数だけ繰り返す。 成功すれば真を返す。 """ cmpX, cmpY = nd.shape ndSize = cmpX * cmpY if (cmpX < 1) or (cmpY < 1) or (self.iX != ndSize): print "ERROR: ipCalc", cmpX, cmpY, self.iX return False work = np.zeros(ndSize) for ay in range(0, cmpY): for ax in range(0, cmpX): work[ay * cmpX + ax] = nd[ax][ay] for aLine in range(0, self.iY): #nArrayの行毎 if ((aLine % 16) == 0) and (not self.debug): print "IP({0})=".format(aLine), sum = 0 if self.debug and (aLine == 0): sum = -0.00268042 for eX in range(0, self.iX): #xを舐める sum += self.nArray[eX][aLine] * work[eX] if self.debug and (aLine == 0): print ">>>({0}) : {1: 05f} {2: 05f} = {3: 05f}".format(eX, self.nArray[eX][aLine], work[eX], sum) if not self.debug: print sum, if ((aLine % 16) == 15) and (not self.debug): print print return True
#======================================================================= # FLTファイルライタクラス
[ドキュメント]class FltFileWriter: """FltFile Writer Class. Numpy 配列をFLT形式ファイルとして出力する。 モードにより整形用の「フィルタ」を適用する。 """ #-------------------------------------------------------------------- # 静的(クラス)変数 static_const_modeDic = dict() static_const_modeDic['none'] = 0 static_const_modeDic['ip8'] = 1 #-------------------------------------------------------------------- # 静的(クラス)メソッド @staticmethod
[ドキュメント] def getModeNumber(modeName): """get Mode Number. モード文字列からモード番号を返す。 """ if modeName in FltFileWriter.static_const_modeDic: return FltFileWriter.static_const_modeDic[modeName] else: return 0
#-------------------------------------------------------------------- def __init__(self, nary, aName, md, padX): """FLT File Writer Constructor コンストラクタ """ # 入力配列 self.IN_nArray = nary #<<! 入力Numpy配列 self.IN_arrayName = aName #<<! 入力FLT配列名 self.IN_iX = 0 #<<! 入力Numpy配列のXサイズ self.IN_iY = 0 #<<! 入力Numpy配列のYサイズ self.IN_iX, self.IN_iY = self.IN_nArray.shape # 出力配列 self.nArray = None #<<! 出力するNumpy配列 self.arrayName = None #<<! 出力FLT配列名 self.iX = 0 #<<! 出力Numpy配列のXサイズ self.iY = 0 #<<! 出力Numpy配列のYサイズ self.fX = 0 #<<! 出力FLT配列のXサイズ self.fY = 0 #<<! 出力FLT配列のYサイズ # mode self.mode = md #<<! モードフラグ self.paddingX = padX #<<! 出力fX方向のパディングサイズ # debug self.debug = False self.verbose = False #--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def formatArray(self): """format Array 入力Numpy配列の形とモードから出力Numpy配列を準備し、 モードに応じた方法でデータを変形しながら転送する。 成功すれば真、そうでなければ偽。 """ if self.mode == FltFileWriter.static_const_modeDic['ip8']: self.arrayName = self.IN_arrayName + "_ip8" return self.makeIP8() else: return False
#--------------------------------------------------------------------
[ドキュメント] def makeIP8(self): """format IP8(inner product x 8 mode) 内積計算8並列モードとなるように入力Numpy配列の行8行を1行とした出力Numpy配列を準備する。 横幅8倍、縦幅8分の1 入力Numpy配列の行8行縦1列を横8要素として出力Numpy配列にコピー (行が8行以下の場合は要素0フィルして8要素とする) 成功すれば真、そうでなければ偽。 """ self.iX = self.IN_iX * 8 self.iY = (self.IN_iY + 7) / 8 if (self.iX > 0) and (self.iY > 0): if self.verbose: print "NEW ARRAY, x:{0} y:{1}".format(self.iX, self.iY) self.nArray = np.zeros((self.iX, self.iY), dtype=np.float) else: return False tempDat = np.zeros(8, dtype=np.float) for oLine in range(0, self.iY): #出力側行番号で舐める for iCol in range(0, self.IN_iX): #入力側列番号で舐める self.nArray[iCol * 8 + 0, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 0] if (oLine * 8 + 0) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 1, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 1] if (oLine * 8 + 1) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 2, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 2] if (oLine * 8 + 2) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 3, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 3] if (oLine * 8 + 3) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 4, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 4] if (oLine * 8 + 4) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 5, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 5] if (oLine * 8 + 5) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 6, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 6] if (oLine * 8 + 6) < self.IN_iY else 0.0 self.nArray[iCol * 8 + 7, oLine] = self.IN_nArray[iCol, oLine * 8 + 7] if (oLine * 8 + 7) < self.IN_iY else 0.0 return True
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[ドキュメント] def writeFLT(self, fname): """write FLT file 出力Numpy配列をFLTファイルへ出力。 出力X方向がpaddingXの倍数でなければpaddingXの倍数になるまで0で埋める。 Numpy配列とFLTファイル上のxが異なることがある。 書き込み成功すれば真 """ #self.fX = ((self.iX + 15) / 16) * 16 segLen = (self.iX + (self.paddingX - 1)) / self.paddingX self.fX = segLen * self.paddingX self.fY = self.iY if self.debug: print self.iX, self.fX, self.paddingX try: with open(fname, 'w') as f: f.write('@{0}<FLOAT>[{1}, {2}] '.format(self.arrayName, self.fX, self.fY) + '{\n' ) lfNum = 0 #行送り用カウンタ for ay in range(0, self.iY): for ax in range(0, self.fX): if ax < self.iX: f.write(str(self.nArray[ax][ay])+", ") else: f.write("0, ") lfNum += 1 if lfNum == 16: #FLTファイルは16要素毎に改行を入れる。 f.write('\n') lfNum = 0 if lfNum != 0: f.write('\n') f.write('} ' + 'nREC={0}, CONV_ERR_CODE=0, CONV_ERR_COUNT=0\n'.format(self.fX*self.fY)) except: stdExceptionHandler("ERROR: Unexpected Error in the writing dump file. ?=" + fname) return False return True
#======================================================================= # メインプログラム def main(): """main. メインプログラム """ #----------------------------------------------------------------------- # コマンドラインオプション処理 # parser = argparse.ArgumentParser(description='fltFormatter, FLT file format utility.') parser.add_argument('--FLT1', nargs=1, help='1st. FLT file name.') parser.add_argument('--ARRAY1', nargs=1, help='Array name, in 1st. FLT file.') parser.add_argument('--FLT2', nargs=1, help='2nd. FLT file name, inner product calculation mode.') parser.add_argument('--ARRAY2', nargs=1, help='Array name, in 2nd. FLT file.') parser.add_argument('--FOUT', nargs=1, help='Output FLT file name.') parser.add_argument('--FMT', nargs=1, help='Formatting mode, (ip8, ...).') parser.add_argument('--PADX', nargs=1, help='X PADDING SIZE (default=256).') parser.add_argument('-d', dest='debug', help='Debug mode, print debug information.', action='store_true', default=False) parser.add_argument('-v', dest='verbose', help='Verbose mode.', action='store_true', default=False) parser.add_argument('-V', dest='VERSION', help='Show Version, then exit', action='store_true', default=False) args = parser.parse_args() #----------------------------------------------------------------------- # Version 表示 # print versionSTR if args.VERSION: sys.exit(0) #----------------------------------------------------------------------- # ファイル名処理 # if args.FLT1 is None: errPrint('ERROR: NO FLT file!') sys.exit(1) else: flt1Fname = args.FLT1[0] if not os.path.isfile(flt1Fname): errPrint('ERROR: FLT1 file, NOT EXIST. ?=' + flt1Fname) sys.exit(1) if args.ARRAY1 is None: errPrint('ERROR: NO ARRAY1 specified!') sys.exit(1) else: array1name = args.ARRAY1[0] if args.FLT2 is None: ipCalcMode = False else: ipCalcMode = True flt2Fname = args.FLT2[0] if not os.path.isfile(flt2Fname): errPrint('ERROR: FLT2 file, NOT EXIST. ?=' + flt2Fname) sys.exit(1) if args.ARRAY2 is None: errPrint('ERROR: NO ARRAY2 specified!') sys.exit(1) else: array2name = args.ARRAY2[0] if args.FOUT is None: errPrint('ERROR: NO OUTPUT FLT file!') sys.exit(1) else: foutFname = args.FOUT[0] #----------------------------------------------------------------------- # パラメータ処理 if args.FMT is None: fmtMode = 0 else: fmtMode = FltFileWriter.getModeNumber(args.FMT[0]) if fmtMode == 0: errPrint('ERROR: Unknown Format mode.') sys.exit(1) if args.PADX is None: paddingX = 256 else: paddingX = tryIntParse(args.PADX[0], 256) #----------------------------------------------------------------------- # 実処理 # print "-"*50 #元ファイルを読み込み flt1 = FltFileReader(flt1Fname, array1name) flt1.debug = args.debug flt1.verbose = args.verbose if not flt1.read(): sys.exit(1) # IP計算モードのとき if ipCalcMode: flt2 = FltFileReader(flt2Fname, array2name) flt2.debug = args.debug flt2.verbose = args.verbose if not flt2.read(): sys.exit(1) if not flt1.ipCalc(flt2.nArray): sys.exit(1) fout = FltFileWriter(flt1.nArray, flt1.tName, fmtMode, paddingX) fout.debug = args.debug fout.verbose = args.verbose if fout.formatArray(): if not fout.writeFLT(foutFname): errPrint("ERROR: Writing FLT file. ?=" + foutFname) sys.exit(1) else: errPrint("ERROR: FLT file Preparation.") sys.exit(1) today = datetime.today() print today.strftime("FINISH: %Y/%m/%d %H:%M:%S") #----------------------------------------------------------------------- # 正常終了 # sys.exit(0) #======================================================================= # メインプログラムの起動 if __name__ == "__main__": main()